یافته‌های دوره‌ی دکترا

گردآوری نکته‌هایی در زمینه‌ی زیست‌شناسی (تکاملی)

بایگانی برچسب‌ها: روش‌شناسی

پایه‌های مقاله نویسی – زبان انگلیسی-

 روشن و گیرا نوشتن یک مقاله می‌تواند به اندازه‌ی خود کار علمی انجام شده در پذیرش مقاله و خوانده شدنش اثرگذار باشد. همان اندازه که خوب مقاله نوشتن می‌تواند اهمیت دارد، یادگیری آن نیز می‌تواند در دسترس باشد. از آنجا که زبان علمی بسیار استاندارد و ساده است، پیروی از یک رشته از اصول دست کم به شیوایی مقاله کمک شایانی می‌کند. این موضوع به ویژه برای کسانی که زبان نخستشان انگلیسی  نیست پرارزش است. در این نوشتار- و بخش‌هایی که در پی خواهد آمد-، این پایه‌های کلی مقاله نویسی، ترتیب آنچه باید در هر بخش از مقاله گفته شود، و نکته‌هایی در کاربرد زبان را بازگو خواهم کرد. با پیروی گام به گام از طرحی که در اینجا می آید، می‌توان فرآیند نوشتن مقاله را ساده تر کرد.
Advertisements

چگونه یک مقاله‌ی علمی را تند بخوانیم؟

در کار پژوهش، به ویژه زمانی که  می‌خواهید کار بر روی موضوعی را آغاز کنید که با آن ناآشنا هستید، بسیار پیش می‌آید که شمار مقاله‌هایی که باید بخوانید یا دوست دارید بخوانید، فراتر از تنگنای زمانی شماست. اگر بخواهید هر مقاله را از آغاز تا پایان بخوانید، نه تنها از خواندن بسیاری از مقاله‌ها باز می‌مانید، که انرژی بسیاری نیز برای خواندن مقاله‌هایی که شاید چندان به کار شما نیایند از دست می‌دهید. پس یافتن روشی که بتوان بیشترین اطلاعات را از هر مقاله در کمترین زمان بیرون کشید بسیار کارا خواهد بود (البته برخی از مقاله‌ها هستند که باید با دقت و خط به خط خوانده شوند، ولی تعداد آنها معمولا بسیار کمتر است).

به تازگی، پس از خواندن توصیه‌های گوناگون در این زمینه، روشی را پیدا کردم که هم برای خود من به خوبی پاسخ‌گو است و هم زمانی که برای هر مقاله باید بپردازم ۵ تا ۱۰ دقیقه است.

ادامهٔ این نوشته را بخوانید

چگونه یک مقاله‌ی پژوهشی را بخوانیم؟

این نوشته بر خلاف نوشته‌ی قبلی، درباره‌ی خواندن یک مقاله‌ی پژوهشی به شکلی کامل است. هدف از خواندن یک مقاله‌ی پژوهشی این است که آنچه را که نویسنده به علم افزوده‌اند درک کنیم. این کار ساده‌ای نیست و ممکن است نیازمند مرور چندین باره‌ی مقاله باشد. پس انتظار داشته باشید که حتی چندین ساعت سر یک مقاله بگذرانید. نکته‌های زیر چند راهنما آغازی درباره‌ی چگونه خواندن یک مقاله هستند: ۱) انتقادی بخوانید. خواندن یک مقاله‌ی پژوهشی باید فرایندی نقادانه باشد. نباید فرض کرد که هر چه که نویسنده‌ها گفته‌اند درست است. به جای آن، مشکوک باشید. خواندن نقادانه برابر است با پرسیدن پرسش‌های مناسب. اگر نویسنده‌ها در تلاشند که به پرسشی پاسخ دهند، آیا در این کار پیروزمند بوده‌اند؟ آیا راه حل‌های ساده‌ای هست که نویسنده‌ها ندیده باشند؟ محدودیت‌های راه حلی که در پیش گرفته اند چیست؟ (از آن میان، آنها که نویسنده‌ها ندیده‌اند یا آنها را بیان نکرده‌اند). آیا فرض‌هایی که نویسنده‌ها برگزیده‌اند درست است؟ آیا منطق مقاله روشن و درست است یا در استدلال کردن‌شان کمبودی هست؟ اگر نویسنده‌ها داده‌ای گردآوری کرده‌اند، آیا به شیوه‌ی درستی این داده‌ها گردآوری شده است؟ آیا داده‌ها درست تفسیر شده اند؟ آیا داده‌های دیگری بهتر می‌بود؟ ۲) خلاقانه بخوانید. خواندن نقادانه‌ی یک مقاله به نسبت کار ساده ای است، چرا که از هم پاشاندن چیزی ساده‌تر از ساختنش است. خلاقانه خواندن نیازمند اندیشه‌ی بیشتر و مثبت‌تری است. ایده‌های خوب این مقاله چه هستند؟ آیا این ایده‌ها کاربردهای دیگری دارند که نویسنده‌ها ممکن است به ذهن شان نرسیده باشد؟ آیا می‌توان آنها را بیشتر تعمیم داد؟ آیا بهبودی می‌توان ایجاد کرد که نتیجه‌های عملی پژوهش را بسیار بهتر کند؟ اگر قرار بود شما پژوهش‌تان را بر پایه ی این مقاله می‌گذاشتید، کار بعدی که می‌کردید چه می‌بود؟ ۳) در هنگام خواندن مقاله یادداشت بردارید.

طراحی پرایمر

در اینجا به همه‌ی اصول و مراحل طراحی پرایمر برای PCR نمی‌پردازم، چرا که آنها را می‌توان از جاهای دیگر هم به آسانی پیدا کرد. ولی می خواهم چند تا نکته‌ای که پیدا کردنش کمی برای خودم زمان برد و به نظرم دانستنش طراحی پرایمر را ساده تر می‌کند بگویم. من برای طراحی پرایمر، از نرم افزار ApE (که در اینجا درباره‌اش نوشته‌ام) برای دریافت دمای ذوب (Tm) و درصد GC پرامر استفاده میکنم. دریافت این اطلاعات از این نرم افزار بسیار ساده است و تنها بسنده است که توالی خود را با موس انتخاب کنید تا این اطلاعات را به شما نشان بدهد. البته این دست اطلاعات ساده را از بسیاری نرم‌افزارها می‌توانید به دست بیاورید. همچنین، پس از اینکه پرایمر را طراحی کرده اید می‌توانید آن را در نرم افزار Primersearch وارد کنید تا ببینید آیا این پرایمرها کار می‌کنند یا نه. این نرم افزار، پس از وارد کردن توانی ژن مورد نظر و پرایمرها، قطعه ای که تکثیر می‌شود را نشان می‌دهد (درباره‌ی چگونگی کار با primersearch در اینجا توضیح داده ام).

ادامهٔ این نوشته را بخوانید

حل پرسش‌های پیش رو

امروز تجربه‌ی کارآمدی در حل کردن پرسش‌های پیش‌روی پژوهش بدست آوردم. جایی خواندم که انشتین گفته بود اگر به من یک ساعت زمان بدهند تا پرسشی را حل کنم که جانم به آن بسته است، ۵۵ دقیقه از این یک ساعت را به طرح پرسش درباره‌ی مساله می‌گذرانم. این رویکرد، به دید من، حل الگوریتم‌وار مساله است. برای حل یک پرسش پیش روی پروژه، یادداشت هر پرسش کوچکی که درباره‌ی بخش‌های گوناگون آن مساله به ذهن می‌رسد و سپس جستجو برای یافتن پاسخ این پرسش‌ها، مساله را خرد و حل شدنی می‌کند