یافته‌های دوره‌ی دکترا

گردآوری نکته‌هایی در زمینه‌ی زیست‌شناسی (تکاملی)

برنامه‌هایی برای هم‌‍تراز کردن (alignment) توالی دی‌ان‌ای یا پروتین

در بخشی از کار خود نیاز داشتم که ژن‌های انسان و موش را هم‌تراز کنم. نخست به سراغ برنامه‌های پرآوازه‌ای چون clustlw و muscle رفتم (برنامه‌ی muscle نتیجه‌ی بسیار بهتری می‌دهد). ولی این برنامه‌ها حافظه‌ی کامپیوتر را پر می‎کنند و توانایی همتراز کردن توالی‌هایی بلندتر از 100kb ندارند. از این رو به دنبال برنامه‌هایی گشتم که برای همتراز کردن ژنونم‌ها به کار می‌روند. ویکیپدیای انگلیسی لیست گسترده‌ای از همه‌ی این برنامه‌های همترازکننده دارد.

http://en.wikipedia.org/wiki/List_of_sequence_alignment_software

Advertisements

پاسخی بگذارید

در پایین مشخصات خود را پر کنید یا برای ورود روی شمایل‌ها کلیک نمایید:

نشان‌وارهٔ وردپرس.کام

شما در حال بیان دیدگاه با حساب کاربری WordPress.com خود هستید. بیرون رفتن /  تغییر دادن )

عکس گوگل+

شما در حال بیان دیدگاه با حساب کاربری Google+ خود هستید. بیرون رفتن /  تغییر دادن )

تصویر توییتر

شما در حال بیان دیدگاه با حساب کاربری Twitter خود هستید. بیرون رفتن /  تغییر دادن )

عکس فیسبوک

شما در حال بیان دیدگاه با حساب کاربری Facebook خود هستید. بیرون رفتن /  تغییر دادن )

w

درحال اتصال به %s

%d وب‌نوشت‌نویس این را دوست دارند: